- DNA to Protein

DNA Sequence Submission

1st base 　2nd base 　3rd base

1-letter 　3-letter

Anti-sense 　Display DNA sequence

"DNA to Protein" について

"DNA to Protein" は DNA 塩基配列をアミノ酸配列に翻訳するプログラムである。

使い方

  1. DNA の塩基配列をテキストボックスに入力する。
  2. 翻訳を始めたい塩基を "1st / 2nd / 3rd base" から選ぶ。
  3. アミノ酸の表記を "1- / 3-letter" から選ぶ。
  4. 相補鎖を翻訳した場合は "Anti-sense" をチェックする。
  5. 翻訳元の DNA 塩基配列を表示させたい場合は "Display DNA sequence" をチェックする。
  6. "Submit" ボタンをクリックする。

補足

  1. A, T, G, C, U, W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D および N を塩基として認識する。大文字小文字のどちらでも良い。ただし、全角文字はエラーになる。
  2. 空白、タブ、改行、数字、ハイフンは無視して翻訳する。ただし、これらの文字が全角の場合はエラーになる。
  3. W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D および N を含むコドンはアミノ酸 X (134.6 Da) に翻訳される。
  4. 途中に出現するストップ・コドンは、0 Da のアミノ酸として処理される。

About "DNA to Protein"

"DNA to Protein" is the program which translates DNA sequence into animo acid sequence.

How to Use

  1. Input DNA sequence into textarea.
  2. Choose "1st / 2nd / 3rd base", the first nucleotide for translation.
  3. Choose "1- / 3-letter", the type of amino acid description.
  4. Check "Anti-sense" if you want to translate anti-sense sequence.
  5. Check "Display DNA sequence" if you need the translated DNA sequence.
  6. Click "Submit" button.

Notes

  1. A, T, G, C, U, W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D, and N are available as nucleotides. Take no notice, upper or lower case.
  2. Space, Tab, Return, Number, and Hyphen characters are ignored.
  3. Codons including W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D, or N are translated to amino acid "X" (134.6 Da).
  4. Stop codon in the middle of sequence is processed as an amino acid (0 Da).

References