DNA Sequence Submission
"DNA to Protein" について
"DNA to Protein" は DNA 塩基配列をアミノ酸配列に翻訳するプログラムである。
使い方
- DNA の塩基配列をテキストボックスに入力する。
- 翻訳を始めたい塩基を "1st / 2nd / 3rd base" から選ぶ。
- アミノ酸の表記を "1- / 3-letter" から選ぶ。
- 相補鎖を翻訳した場合は "Anti-sense" をチェックする。
- 翻訳元の DNA 塩基配列を表示させたい場合は "Display DNA sequence" をチェックする。
- "Submit" ボタンをクリックする。
補足
- A, T, G, C, U, W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D および N を塩基として認識する。大文字小文字のどちらでも良い。ただし、全角文字はエラーになる。
- 空白、タブ、改行、数字、ハイフンは無視して翻訳する。ただし、これらの文字が全角の場合はエラーになる。
- W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D および N を含むコドンはアミノ酸 X (134.6 Da) に翻訳される。
- 途中に出現するストップ・コドンは、0 Da のアミノ酸として処理される。
About "DNA to Protein"
"DNA to Protein" is the program which translates DNA sequence into animo acid sequence.
How to Use
- Input DNA sequence into textarea.
- Choose "1st / 2nd / 3rd base", the first nucleotide for translation.
- Choose "1- / 3-letter", the type of amino acid description.
- Check "Anti-sense" if you want to translate anti-sense sequence.
- Check "Display DNA sequence" if you need the translated DNA sequence.
- Click "Submit" button.
Notes
- A, T, G, C, U, W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D, and N are available as nucleotides. Take no notice, upper or lower case.
- Space, Tab, Return, Number, and Hyphen characters are ignored.
- Codons including W, R, M, K, Y, S, H, B, V, D, or N are translated to amino acid "X" (134.6 Da).
- Stop codon in the middle of sequence is processed as an amino acid (0 Da).
References